რა არის უჯრედში შეღწევადი პეპტიდები?

უჯრედში შეღწევადი პეპტიდები არის პატარა პეპტიდები, რომლებსაც შეუძლიათ ადვილად შეაღწიონ უჯრედის მემბრანაში.მოლეკულების ეს კლასი, განსაკუთრებით CPP-ები სამიზნე ფუნქციებით, დაპირებაა სამიზნე უჯრედებისთვის წამლის ეფექტური მიწოდებისთვის.

ამიტომ მასზე კვლევას გარკვეული ბიოსამედიცინო მნიშვნელობა აქვს.ამ კვლევაში, სხვადასხვა ტრანსმემბრანული აქტივობის CPP-ები შეისწავლეს თანმიმდევრობის დონეზე, ცდილობდნენ გაერკვნენ CPP-ების ტრანსმემბრანულ აქტივობაზე მოქმედი ფაქტორები, თანმიმდევრობითი განსხვავებები CPP-ებს შორის სხვადასხვა აქტივობით და NonCPP-ებს შორის და დანერგეს ბიოლოგიური თანმიმდევრობების ანალიზის მეთოდი.

CPPs და NonCPPs თანმიმდევრობები მიღებული იყო CPPsite მონაცემთა ბაზიდან და სხვადასხვა ლიტერატურიდან, ხოლო ტრანსმემბრანული პეპტიდები (HCPPs, MCPPs, LCPPs) მაღალი, საშუალო და დაბალი ტრანსმემბრანული აქტივობით იქნა ამოღებული CPPs თანმიმდევრობიდან მონაცემთა ნაკრების ასაგებად.ამ მონაცემთა ნაკრების საფუძველზე ჩატარდა შემდეგი კვლევები:

1, სხვადასხვა აქტიური CPP-ისა და NonCPP-ის ამინომჟავა და მეორადი სტრუქტურის შემადგენლობა გაანალიზებული იყო ANOVA-ით.აღმოჩნდა, რომ ამინომჟავების ელექტროსტატიკური და ჰიდროფობიური ურთიერთქმედება მნიშვნელოვან როლს ასრულებდა CPP-ების ტრანსმემბრანულ აქტივობაში, ხოლო ხვეული სტრუქტურა და შემთხვევითი დახვევა ასევე გავლენას ახდენდა CPP-ების ტრანსმემბრანულ აქტივობაზე.

2. ორგანზომილებიან სიბრტყეზე ნაჩვენები იყო სხვადასხვა აქტივობის CPP-ების ფიზიკური და ქიმიური თვისებები და სიგრძე.აღმოჩნდა, რომ სხვადასხვა აქტივობის CPP-ები და NonCPP-ები შეიძლება დაჯგუფდეს ზოგიერთ სპეციალურ თვისებებში და HCPPs, MCPPs, LCPPs და NonCPPs დაიყო სამ კლასტერად, რაც აჩვენებს მათ განსხვავებებს;

3. ამ ნაშრომში მოცემულია ბიოლოგიური თანმიმდევრობის ფიზიკური და ქიმიური ცენტრის ცნება და თანმიმდევრობის შემადგენელი ნარჩენები განიხილება როგორც ნაწილაკების წერტილები და თანმიმდევრობა აბსტრაქტულია როგორც კვლევისთვის ნაწილაკების სისტემა.ეს მეთოდი გამოიყენებოდა CPP-ების ანალიზზე სხვადასხვა აქტივობების მქონე CPP-ების პროექციით 3D სიბრტყეზე PCA მეთოდით და აღმოჩნდა, რომ CPP-ების უმეტესობა დაჯგუფებულია ერთად და ზოგიერთი LCPP ჯგუფურია NonCPP-ებთან ერთად.

ეს კვლევა გავლენას ახდენს CPP-ების დიზაინზე და აცნობიერებს განსხვავებებს CPP-ების თანმიმდევრობაში სხვადასხვა აქტივობით.გარდა ამისა, ამ ნაშრომში წარმოდგენილი ბიოლოგიური თანმიმდევრობების ფიზიკური და ქიმიური ცენტროიდის ანალიზის მეთოდი ასევე შეიძლება გამოყენებულ იქნას სხვა ბიოლოგიური პრობლემების ანალიზისთვის.ამავდროულად, ისინი შეიძლება გამოყენებულ იქნას, როგორც შეყვანის პარამეტრები ზოგიერთი ბიოლოგიური კლასიფიკაციის პრობლემებისთვის და როლი შეასრულონ ნიმუშის ამოცნობაში.