ანტიმიკრობული პეპტიდების ოთხი მახასიათებელი

ეს ანტიმიკრობული პეპტიდები თავდაპირველად მიღებული იყო მწერების, ძუძუმწოვრების, ამფიბიების და ა.შ. თავდაცვის სისტემებიდან და ძირითადად მოიცავს ოთხ კატეგორიას:

1. ცეკროპინი თავდაპირველად იყო ცეკროპიამოტის იმუნურ ლიმფში, რომელიც ძირითადად გვხვდება სხვა მწერებში და მსგავსი ბაქტერიციდული პეპტიდები ასევე გვხვდება ღორის ნაწლავებში.ისინი, როგორც წესი, ხასიათდებიან ძლიერ ტუტე N-ტერმინალური რეგიონით, რასაც მოჰყვება გრძელი ჰიდროფობიური ფრაგმენტი.

2. ქსენოპუსის ანტიმიკრობული პეპტიდები (მაგაინინი) მიიღება ბაყაყების კუნთებიდან და კუჭიდან.ქსენოპუსის ანტიმიკრობული პეპტიდების სტრუქტურა ასევე აღმოჩნდა ხვეული, განსაკუთრებით ჰიდროფობიურ გარემოში.ქსენოპუსის ანტიპეპტიდების კონფიგურაცია ლიპიდურ შრეებში შესწავლილი იყო N-მონიშნული მყარი ფაზის NMR-ით.აცილამინის რეზონანსის ქიმიურ ცვლაზე დაყრდნობით, ქსენოპუსის ანტიპეპტიდების ხვეულები წარმოადგენდნენ პარალელურ ორშრიანი ზედაპირებს და მათ შეეძლოთ გადაიზარდოს 13 მმ-იანი გალიის შესაქმნელად, პერიოდული ხვეული სტრუქტურით 30 მმ.

3. დეფენსინის თავდაცვის პეპტიდები მიიღება ადამიანის პოლიკარიოტული ნეიტროფილური კურდღლის პოლიმაკროფაგებიდან სრული ბირთვული ლობულით და ცხოველების ნაწლავის უჯრედებით.ანტიმიკრობული პეპტიდების ჯგუფი, რომლებიც მსგავსია ძუძუმწოვრების დამცავი პეპტიდებისა, მწერებისგან იქნა მოპოვებული, სახელწოდებით "მწერებისგან დაცვის პეპტიდები".ძუძუმწოვრების დამცავი პეპტიდებისგან განსხვავებით, მწერებისგან დამცავი პეპტიდები აქტიურია მხოლოდ გრამდადებითი ბაქტერიების წინააღმდეგ.მწერებისგან დამცავი პეპტიდებიც კი შეიცავს Cys-ის ექვს ნარჩენს, მაგრამ ერთმანეთთან დისულფიდური კავშირის მეთოდი განსხვავებულია.Drosophila melanogast-დან ამოღებული ანტიბაქტერიული პეპტიდების ინტრამოლეკულური დისულფიდური ხიდის შეკავშირების რეჟიმი მსგავსი იყო მცენარეთა დაცვის პეპტიდების.ბროლის პირობებში დამცავი პეპტიდები წარმოდგენილია დიმერების სახით.

4.ტაქიპლესინი მიიღება ცხენის ბუჩქებისგან, რომელსაც ეძახიან.კონფიგურაციის კვლევებმა აჩვენა, რომ იგი იღებს ანტიპარალელური B- დასაკეცი კონფიგურაციას (3-8 პოზიციები, 11-16 პოზიციები), რომელშიცβ-კუთხე ერთმანეთთან არის დაკავშირებული (8-11 პოზიციები) და წარმოიქმნება ორი დისულფიდური ბმა 7 და 12 პოზიციებს შორის და 3 და 16 პოზიციებს შორის.ამ სტრუქტურაში ჰიდროფობიური ამინომჟავა განლაგებულია სიბრტყის ერთ მხარეს, ხოლო ექვსი კათიონური ნარჩენი ჩნდება მოლეკულის კუდზე, ამიტომ სტრუქტურაც ბიოფილიურია.

აქედან გამომდინარეობს, რომ თითქმის ყველა ანტიმიკრობული პეპტიდი არის კათიონური ბუნებით, მიუხედავად იმისა, რომ ისინი განსხვავდება სიგრძით და სიმაღლით;მაღალ დონეზე, ალფა-სპირალის სახით თუβ- დასაკეცი, ბიტროპული სტრუქტურა საერთო მახასიათებელია.